RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 Q6ZRG5 221 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IFI44Q8TCB0 444 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SAP25Q8TEE9 199 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PP6455Q8WZ26 134 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CRLF2Q9HC73 371 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PADI1Q9ULC6 663 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SGCEO43556 437 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NME2P1O60361 137 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DEDDO75618 318 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FCGR3AP08637 254 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PET100P0DJ07 73 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF32P17041 273 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ALDH3B1P43353 468 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FHITP49789 147 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF84P51523 738 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SSR4P51571 173 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM33P57088 247 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SLC22A25Q6T423 547 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 Q6ZPA2 131 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM156Q8N614 296 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SPTSSAQ969W0 71 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM8Q96KF7 97 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 WFDC1Q9HC57 220 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 GHRLQ9UBU3 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 WNT16Q9UBV4 365 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RFNGQ9Y644 331 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PATE3B3GLJ2 98 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CXCL13O43927 109 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 C1QL1O75973 258 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CFIP05156 583 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CRYBA1P05813 215 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF728P0DKX0 622 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SPP1P10451 314 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CRYGSP22914 178 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HTR5AP47898 357 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 KCNJ3P48549 501 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CAV2P51636 162 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TGIF1Q15583 401 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OPN5Q6U736 354 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 BTNL8Q6UX41 500 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 GPHA2Q96T91 129 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PRRX2Q99811 253 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SEC11CQ9BY50 192 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 METTL9Q9H1A3 318 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MEMO1Q9Y316 297 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CACNA1EQ15878 2313 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NCKAP5O14513 1909 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087WZY1 265 aa6.31□□□□□ -1.4
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