RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 PRRG3Q9BZD7 231 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 HES4Q9HCC6 221 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 R4GMQ9 66 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 M0R129 80 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 TK1P04183 234 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PIPP12273 146 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CALHM1Q8IU99 346 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CFHR4Q92496 578 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 MNTQ99583 582 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 POMPQ9Y244 141 aa15.9■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 MEGF11A6BM72 1044 aa15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 MPZP25189 248 aa15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ANGPTL5Q86XS5 388 aa15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.89■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 C17orf98A8MV24 154 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 G3V4G9 280 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 OPN1MWP04001 364 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 OPN1MW2P0DN77 364 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 OPN1MW3P0DN78 364 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 DLX6P56179 175 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ERVK11-1P61568 191 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 EFNB1P98172 346 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 PLA1AQ53H76 456 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 Q6ZSR3 168 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 DYNAPQ8N1N2 210 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 DTX3Q8N9I9 347 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM163Q8TC26 289 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 PKIBQ9C010 78 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 CLN6Q9NWW5 311 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 SLC22A13Q9Y226 551 aa15.88■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 VGLL3A8MV65 326 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 K7N7A8 449 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 EPHA2P29317 976 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 RAB13P51153 203 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 COL10A1Q03692 680 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 IL24Q13007 206 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 KRT84Q9NSB2 600 aa15.87■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 RPP14O95059 124 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ARG1P05089 322 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 CCL1P22362 96 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ODF4Q2M2E3 257 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 C12orf73Q69YU5 71 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 SSX6Q7RTT6 188 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 YIPF7Q8N8F6 280 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 TCF19Q9Y242 345 aa15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZAR1LA6NP61 321 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 F8VVB4 439 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 F8VWA3 439 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 H3BSH0 61 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 KRT8P05787 483 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 CHRM2P08172 466 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF728P0DKX0 622 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 EDDM3BP56851 147 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 FAM189A2Q15884 450 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 SAMD5Q5TGI4 173 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 GID4Q8IVV7 300 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 LYG1Q8N1E2 194 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 OR13D1Q8NGV5 346 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 TBX5Q99593 518 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF702PQ9H963 129 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.85■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ODF3BA8MYP8 253 aa15.84■□□□□ 0.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF737O75373 536 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms