RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 IQCF3P0C7M6 154 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 EFNA3P52797 238 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 FAM57BQ71RH2 274 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 DGAT2Q96PD7 388 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 CLN8Q9UBY8 286 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 OR1A2Q9Y585 309 aa9.53□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 OR2W5A6NFC9 320 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 M0QZ24 198 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 KLK8O60259 260 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 CA2P00918 260 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 AMBPP02760 352 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 FUT3P21217 361 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 RAC1P63000 192 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 SPRYD7Q5W111 196 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 Q7L0L9 218 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
KPNA3-201ENST00000261667 CEP290O15078 2479 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HMGN4O00479 90 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CA11O75493 328 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 GPM6AP51674 278 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TPPP3Q9BW30 176 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 RAMP1O60894 148 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 VAMP5O95183 116 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 IAPPP10997 89 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PNMTP11086 282 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HYAL1Q12794 435 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SPACA5Q96QH8 159 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PKIBQ9C010 78 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 B4GALT2O60909 372 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 IGFBP4P22692 258 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CDKN1BP46527 198 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 RND3P61587 244 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 MANBALQ9NQG1 85 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.52□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 THBS2P35442 1172 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 P2RY1P47900 373 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 RING1Q06587 406 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 DUSP8Q13202 625 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF77Q15935 545 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 WBP1LQ9NX94 342 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 A0A0U1RQF3 1178 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 F5H5K5 113 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 NPIPB7O75200 414 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1B0GWA3 101 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 FCGR2AP12318 317 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ATP6V0CP27449 155 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HTR1DP28221 377 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OPRM1P35372 400 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PPICP45877 212 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR2L13Q8N349 312 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR4X1Q8NH49 305 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 RLN3Q8WXF3 142 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SLC17A5Q9NRA2 495 aa9.51□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.5□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF749O43361 778 aa9.5□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 IL13RA2Q14627 380 aa9.5□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.5□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 C1QL4Q86Z23 238 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms