RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CASTOR1Q8WTX7 329 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 FGGYQ96C11 551 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGQQ9BRB3 760 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 MOB1AQ9H8S9 216 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC18AA5D8T8 446 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY10O00398 339 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ZG16O60844 167 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CBX5P45973 191 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC18BQ6UXF7 455 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4K15Q8NH41 348 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM206AQ9NX38 181 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB11Q9UBS4 358 aa22.92■■□□□ 1.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF708P17019 499 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB13P51153 203 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 SEM1Q6ZVN7 128 aa22.91■■□□□ 1.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK17Q96T54 332 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WZY1 265 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF98A6NK75 572 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ADORA2A-AS1P86434 159 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 OTPQ5XKR4 325 aa22.9■■□□□ 1.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR52W1Q6IF63 320 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SKA3Q8IX90 412 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 GVQW1Q8N7I0 195 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ST8SIA1Q92185 356 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP10Q96PS8 301 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF126Q9BV68 326 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CYTL1Q9NRR1 136 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 TAAR5O14804 337 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT7O43581 403 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 MPZL1O95297 269 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 GNALP38405 381 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CASP6P55212 293 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CDSNQ15517 529 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 GGNQ86UU5 652 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP57Q9NU63 452 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR132Q9UNW8 380 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa22.89■■□□□ 1.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR52N4Q8NGI2 321 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJA3Q96EY1 480 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC100509620A0A075B734 347 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC5O15389 551 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SSX5O60225 188 aa22.88■■□□□ 1.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 SFTPDP35247 375 aa22.88■■□□□ 1.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR10H5Q8NGA6 315 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCFQ9NPI8 374 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ATPIF1Q9UII2 106 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK7Q96N67 2140 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 FIGNL2A6NMB9 653 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 E9PLN8 166 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A18H0YCH9 400 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM157CP0CG43 387 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF17P17021 662 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SGCAQ16586 387 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A18Q3C1V0 323 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH1Q8TCQ1 289 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 VKORC1Q9BQB6 163 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOIQ9C0D9 397 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 PBOV1Q9GZY1 135 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCC1Q9NVA1 299 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 GNB3P16520 340 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 FPR2P25090 351 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A53Q5H9E4 307 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM8Q8N371 416 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 CMBLQ96DG6 245 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIB1Q96RU8 372 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 OCSTAMPQ9BR26 566 aa22.87■■□□□ 1.25
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