RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 LHX6Q9UPM6 363 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 MPC1Q9Y5U8 109 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 H3BUI4 141 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 K7EM74 188 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 TOXO94900 526 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GSTT2P0CG29 244 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 COX5AP20674 150 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GTF3C1Q12789 2109 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC25A42Q86VD7 318 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 OR11H4Q8NGC9 324 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GON7Q9BXV9 100 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 LUZP4Q9P127 313 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CACNA1GO43497 2377 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CHATP28329 748 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 RBM11P57052 281 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 DHRS2Q13268 280 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SAXO1Q8IYX7 474 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 OR10AD1Q8NGE0 317 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5AP2Q8NGF4 316 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 RADILQ96JH8 1075 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR137Q96N19 417 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 EHFQ9NZC4 300 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SVILO95425 2214 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2T2Q6IF00 324 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 MARCH1Q8TCQ1 289 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 AK3Q9UIJ7 227 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A5O76082 557 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2A4O95047 310 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 NPBWR2P48146 333 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1CBP62140 327 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 MKXQ8IYA7 352 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 SLAMF9Q96A28 289 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2A7Q96R45 310 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 PPA2Q9H2U2 334 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 PIPOXQ9P0Z9 390 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 EDARQ9UNE0 448 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 SMPD2O60906 423 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 ARPC4P59998 168 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 BATF2Q8N1L9 274 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5P3Q8WZ94 311 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 SCGB3A2Q96PL1 93 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF581Q9P0T4 197 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 F5H5P2 479 aa20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 TNFSF13O75888 250 aa20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF610Q8N9Z0 462 aa20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 FAHD2AQ96GK7 314 aa20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 POM121Q96HA1 1249 aa20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC120Q96HB5 630 aa20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5B21A6NL26 309 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAPPC2LH3BP13 241 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR1O75083 606 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 PDCD6O75340 191 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 SIX6O95475 246 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 CBR1P16152 277 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 AKR1C4P17516 323 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 BCL3P20749 454 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 CD34P28906 385 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 NPY4RP50391 375 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 TAS2R31P59538 309 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 C2orf68Q2NKX9 166 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXW12Q6X9E4 464 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 LYG2Q86SG7 212 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM200AQ86VY9 491 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 STARD4Q96DR4 205 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF35P13682 527 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 H2BFSP57053 126 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 GNG3P63215 75 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 IL13RA1P78552 427 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1R1AQ13522 171 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 MPPED2Q15777 294 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF573Q86YE8 665 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 BOD1Q96IK1 185 aa20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 LILRA1O75019 489 aa20.54■□□□□ 0.88
RPUSD1-201ENST00000007264 FUT3P21217 361 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms