RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Samd8Q9DA37 478 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chrm2Q9ERZ4 466 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc2a8Q9JIF3 477 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas2r4Q9JKT3 297 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Asah1Q9WV54 394 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mapk7Q9WVS8 806 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lhx2Q9Z0S2 406 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PlpbpQ9Z2Y8 274 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Shank1D3YZU1 2167 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4930563M21RikA0A1L1SUT5 578 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndufaf6A2AIL4 333 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm15080A2BI02 449 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r9A2RST7 299 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tomm5B1AXP6 51 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr225E9PWF9 419 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8126E9Q1N7 198 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adamts3E9Q287 1204 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc74aE9Q9U8 364 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4933403O08RikF6UK53 379 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr895L7N210 316 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21750L7N228 499 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psmb1O09061 240 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Capn1O35350 713 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NlkO54949 527 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Agr2O88312 175 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PomcP01193 235 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P04945 108 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 C2cd4dP0CG09 341 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Crisp2P16563 243 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Selenbp1P17563 472 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc2a1P17809 492 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Espl1P60330 2118 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ear2P97425 156 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il9rQ01114 468 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr90Q0VEL5 310 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MamstrQ0ZCJ7 421 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PilrbQ2YFS2 224 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ankrd33bQ3U0L2 486 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam160a2Q3U2I3 975 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trpc5osQ3UHV4 110 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Thsd4Q3UTY6 1018 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q3UUX7 111 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Diras2Q5PR73 199 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pld6Q5SWZ9 221 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyb561Q60720 250 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usf1Q61069 310 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc17a1Q61983 465 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SrmQ64674 302 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pptc7Q6NVE9 310 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tdpoz5Q6YCH1 340 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas2r113Q7M711 309 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp747Q8BHM7 422 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxw13Q8BI57 466 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GldnQ8BMF8 549 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plekha1Q8BUL6 383 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnfsfm13Q8BXS2 410 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Frmd6Q8C0V9 622 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc25a42Q8R0Y8 318 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc25a28Q8R0Z5 364 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fcrl1Q8R4Y0 343 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Swsap1Q8VCI7 278 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem5Q8VDX6 444 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhga3Q91XY5 928 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cryzl1Q921W4 348 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcbld1Q9D4J3 503 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9DAZ5 108 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mlf1Q9QWV4 267 aa8.13□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcnx3Q8VI59 2028 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm35060A0A140LIV7 231 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1130A0A1L1SQT2 314 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1129A2AV41 314 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnaset2aC0HKG5 259 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnaset2bC0HKG6 259 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r174E9PYW5 313 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr68E9PYY2 315 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1471F6QVZ8 314 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8356J3QPD3 205 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp977L7N2E7 438 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dhrs3O88876 302 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01795 144 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2-Ab1P01921 265 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P06344 263 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P20040 264 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PvalbP32848 110 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SgcbP82349 320 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A4gntQ14BT6 341 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem104Q3TB48 496 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pate2Q3UW31 111 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Foxb1Q64732 325 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr374Q7TRY0 313 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr285Q7TS17 319 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp955aQ80XR7 545 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stk35Q80ZW0 539 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 QpctlQ8BH73 383 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdadc1Q8BMD5 523 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NrrosQ8BMT4 693 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Yipf6Q8BR70 236 aa8.12□□□□□ -1.11
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Commd2Q8BXC6 199 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.5 ms