RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PPE2 198 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PR64 198 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PRV1 198 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 PGA5P0DJD9 388 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 COX7A1P24310 79 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 BMXP51813 675 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 LGALS4P56470 323 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 ERVFRD-1P60508 538 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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PTPRF-216ENST00000617451 COPS3Q9UNS2 423 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRF-216ENST00000617451 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 TCF19Q9Y242 345 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 AQP12BA6NM10 295 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 DLGAP1O14490 977 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 PIN1P1O15428 100 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 XPNPEP2O43895 674 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 T-ENOLP0DO92 83 aa20.13■□□□□ 0.81
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