RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBG1P23258 451 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OPRD1P41143 372 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 TPPP2P59282 170 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 PFN3P60673 137 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 PAFAH1B2P68402 229 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 NR0B2Q15466 257 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 MMDQ15546 238 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CDKN3Q16667 212 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 DECR1Q16698 335 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR2T27Q8NH04 317 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 NUS1Q96E22 293 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CAPN10Q9HC96 672 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 H0YIZ8 118 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC16A5O15375 505 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CTAG2O75638 210 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 STK17BO94768 372 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 NDUFB8O95169 186 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 HBE1P02100 147 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 GZMHP20718 246 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 FUT3P21217 361 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 KHKP50053 298 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 RIPPLY3P57055 190 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM33P57088 247 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF85Q03923 595 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 PDGFRLQ15198 375 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6ZN92 141 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 MTURNQ8N3F0 131 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 STPG4Q8N801 248 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA1456Q9P272 454 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 VSIG4Q9Y279 399 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 RCBTB2O95199 551 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC2A10O95528 541 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 MT-CO2P00403 227 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 STATHP02808 62 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 NBL1P41271 181 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 TAS2R50P59544 299 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 NSDHLQ15738 373 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 PSG3Q16557 428 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM215Q68D42 235 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF627Q7L945 461 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR4S2Q8NH73 311 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF563Q8TA94 476 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CKAP5Q14008 2032 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 METAP1P53582 386 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SPEM2Q0P670 501 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ERGIC1Q969X5 290 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ARRDC3Q96B67 414 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM186Q96B77 213 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 PSG11Q9UQ72 335 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CORTO00230 105 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 FGF17O60258 216 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC6A12P48065 614 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 SLAQ13239 276 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 RAB32Q13637 225 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF480Q8WV37 535 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms