RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 RELNP78509 3460 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JMP0 313 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0X1KG70 313 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CTDSPLO15194 276 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ADIPOQQ15848 244 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF181Q2M3W8 571 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A26Q70HW3 274 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8NFD4 153 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4M2Q8NGB6 313 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 PLK3Q9H4B4 646 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 TAAR3PQ9P1P4 343 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QT63 122 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MPIG6BO95866 241 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2F2P13984 249 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MGMTP16455 207 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM104Q8NE00 496 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM222BQ8WU58 562 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB108AA8MXU0 73 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGPTL7O43827 346 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 UPK1BO75841 260 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 PLATP00750 562 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA2P20848 420 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM204Q9BSN7 226 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 TM2D1Q9BX74 207 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 LPAR5Q9H1C0 372 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MSL2Q9HCI7 577 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 WIPF3A6NGB9 483 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YL77 283 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4A8P0C604 315 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ELP2Q6IA86 826 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 OR56B1Q8NGI3 324 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 HTR3BO95264 441 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1D-12P01611 117 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFBP2P18065 325 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CPT2P23786 658 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CD200P41217 278 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R20P59543 309 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 NKPD1Q17RQ9 610 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8N402 240 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM89BQ8N5H3 189 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10AD1Q8NGE0 317 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD1Q96SE0 405 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 DIRC2Q96SL1 478 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM208BQ5VWN6 2430 aa26.39■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 E7EQL1 145 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC2LH3BP13 241 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB27BO00194 218 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 SIAH2O43255 324 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR7A2O43488 359 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 LOXP28300 417 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 PTH2RP49190 550 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF154Q13106 437 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 BIVMQ86UB2 503 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP3Q92482 292 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 TLNRD1Q9H1K6 362 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 BANF2Q9H503 90 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS44E7EML9 344 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DQB1P01920 261 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-206ENST00000588815 WDR86Q86TI4 376 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8IYB0 196 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-206ENST00000588815 SCCPDHQ8NBX0 429 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10K1Q8NGX5 313 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PP11 408 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 F5H5P2 479 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 ADH4P08319 380 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF81P51508 661 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 EFNB3Q15768 340 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8H2Q8N162 312 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 DTX3Q8N9I9 347 aa26.36■■□□□ 1.81
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CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3IP1Q96FE7 263 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 Q96M66 194 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 SELENOIQ9C0D9 397 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF462Q96JM2 2506 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 ISPDA4D126 451 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 GOSR1O95249 250 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 VEGFCP49767 419 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-206ENST00000588815 MAB21L1Q13394 359 aa26.36■■□□□ 1.81
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