RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR5B21A6NL26 309 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM212A6NML5 194 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SRRM5B3KS81 715 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TBX1O43435 398 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GPX5O75715 221 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SC5DO75845 299 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GRPP07492 148 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PPIAL4GP0DN37 164 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CD37P11049 281 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 FAHP16930 419 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CFPP27918 469 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP6V1E1P36543 226 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PSMB10P40306 273 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ERVK11-1P61568 191 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MZT1Q08AG7 82 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PRDX4Q13162 271 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR82Q6UXN9 313 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 LYPD6Q86Y78 171 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PP6455Q8WZ26 134 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SMIM19Q96E16 107 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TECTBQ96PL2 329 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR51I2Q9H344 312 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BRD7Q9NPI1 651 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CLN8Q9UBY8 286 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GNG8Q9UK08 70 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 LGALS8O00214 317 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 P2RY10O00398 339 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 NDUFA2O43678 99 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PEX14O75381 377 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 FCN3O75636 299 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 AMY2BP19961 511 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PRTN3P24158 256 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 NPY4RP50391 375 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 WNT4P56705 351 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GABARAPL2P60520 117 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GNG3P63215 75 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR50Q13585 617 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 UBE2V2Q15819 145 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNJ8Q15842 424 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 AHSA2Q719I0 299 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 RDH10Q8IZV5 341 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 Q8NFD4 153 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OR8S1Q8NH09 359 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms