RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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SPNS3-204ENST00000575194 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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SPNS3-204ENST00000575194 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
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SPNS3-204ENST00000575194 C12orf49Q9H741 205 aa16.19■□□□□ 0.18
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SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB25P24278 435 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-204ENST00000575194 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-204ENST00000575194 LIN54Q6MZP7 749 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-204ENST00000575194 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-204ENST00000575194 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-204ENST00000575194 OR5L1Q8NGL2 311 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-204ENST00000575194 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-204ENST00000575194 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-204ENST00000575194 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
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