RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	CHD1	O14646	1710 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A0G2JND7	137 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	AGFG2	O95081	481 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ADRA2A	P08913	450 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5AC1	P0C628	307 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM225B	P0DP42	221 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SOX3	P41225	446 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZIC1	Q15915	447 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SYTL3	Q4VX76	610 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FTMT	Q8N4E7	242 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	WBP1	Q96G27	269 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ADGRL2	O95490	1459 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GFRA3	O60609	400 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM20B	O75063	409 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HBZ	P02008	142 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GZMB	P10144	247 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF17	P17021	662 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LEP	P41159	167 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	UPP1	Q16831	310 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CBLL1	Q75N03	491 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2T27	Q8NH04	317 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PELI2	Q9HAT8	420 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR1A2	Q9Y585	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PALLD	Q8WX93	1383 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MBD5	Q9P267	1494 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ABCC5	O15440	1437 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1B0GW64	132 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM231B	A6NCW3	169 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TNFRSF11B	O00300	401 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SMIM17	P0DL12	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF19	P17023	458 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TNFRSF1B	P20333	461 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NFYB	P25208	207 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PSG6	Q00889	435 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FMOD	Q06828	376 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF773	Q6PK81	442 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	VAMP8	Q9BV40	100 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FZR1	Q9UM11	496 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A0G2JMM0	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1W2PPB8	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SHISA3	A0PJX4	238 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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