RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 ZNF573Q86YE8 665 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 BATF2Q8N1L9 274 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 TMEM86BQ8N661 226 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 OR4F5Q8NH21 305 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 DYRK2Q92630 601 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 RFKQ969G6 155 aa7.41□□□□□ -1.22
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LMO3-222ENST00000540445 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 A0A1B0GTI1 187 aa7.4□□□□□ -1.22
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LMO3-222ENST00000540445 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 MEIOCA2RUB1 952 aa7.4□□□□□ -1.22
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LMO3-222ENST00000540445 SLC1A7O00341 560 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 NPFFO15130 113 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 SYT7O43581 403 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 SYNGR1O43759 233 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 INMTO95050 263 aa7.4□□□□□ -1.22
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LMO3-222ENST00000540445 PAHP00439 452 aa7.4□□□□□ -1.22
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LMO3-222ENST00000540445 IGHV4-59P01825 116 aa7.4□□□□□ -1.22
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LMO3-222ENST00000540445 PRDX2P32119 198 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 RAG2P55895 527 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 KLRD1Q13241 179 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 PRR31Q5SQ13 230 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 SSX6Q7RTT6 188 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 Q8N7P7 452 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 ZNF488Q96MN9 340 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 SLITRK2Q9H156 845 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 C1RLQ9NZP8 487 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 GNG8Q9UK08 70 aa7.4□□□□□ -1.22
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LMO3-222ENST00000540445 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-222ENST00000540445 V9GYS6 101 aa7.4□□□□□ -1.22
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LMO3-222ENST00000540445 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PPE2 198 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PPH5 198 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PR64 198 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PRV1 198 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.39□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 J3QT63 122 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 M0R1W7 72 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 WIPF1O43516 503 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 SULT1C4O75897 302 aa7.39□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 ZNF561Q8N587 486 aa7.39□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.39□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 RORBQ92753 470 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 UBE2FQ969M7 185 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 EME1Q96AY2 570 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 SDSLQ96GA7 329 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 VWFP04275 2813 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 DAPL1A0PJW8 107 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.38□□□□□ -1.23
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