RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 R4GMQ9 66 aa20.16■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 J3QT63 122 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 TGFBR2P37173 567 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 HAAOP46952 286 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 MIDNQ504T8 468 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF573Q86YE8 665 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 TCEANCQ8N8B7 351 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM163Q8TC26 289 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF488Q96MN9 340 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 APOL4Q9BPW4 351 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 TCF7L1Q9HCS4 588 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.15■□□□□ 0.82
ALYREF-203ENST00000511412 RFPL4AA6NLU0 287 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 SLC1A7O00341 560 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 SYNGR1O43759 233 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ANGPTL7O43827 346 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 TSPAN9O75954 239 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 PGA5P0DJD9 388 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 AADACL4Q5VUY2 407 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 C12orf73Q69YU5 71 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ASPHD2Q6ICH7 369 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 HCP5Q6MZN7 132 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF561Q8N587 486 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 BEND2Q8NDZ0 799 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 UBE2FQ969M7 185 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 GPR173Q9NS66 373 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 C19orf12Q9NSK7 152 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 CLN6Q9NWW5 311 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 V9GYS6 101 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 CMYA5Q8N3K9 4069 aa20.14■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1W2PPH5 198 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD61A6NGH8 418 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ZAR1LA6NP61 321 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 DLGAP1O14490 977 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 EGR3Q06889 387 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ATP6AP1Q15904 470 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM42Q69YG0 159 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 GID4Q8IVV7 300 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 CD177Q8N6Q3 437 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 G3V2T6 193 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 H3BUX3 64 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 DYNC1I1O14576 645 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 NXPH2O95156 264 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 EPHA2P29317 976 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 RPL31P62899 125 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 EFNB1P98172 346 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ASRGL1Q7L266 308 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 PPA2Q9H2U2 334 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ENOPH1Q9UHY7 261 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 PQLC2LA1A4F0 135 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 DHRS7CA6NNS2 312 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 PRDX2P32119 198 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 KDM4DQ6B0I6 523 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 MKXQ8IYA7 352 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 NRIP2Q9BQI9 281 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1B0GTI1 187 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 BATF2Q8N1L9 274 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 C17orf50Q8WW18 174 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 SSX3Q99909 188 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 FAM234AQ9H0X4 552 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHA1Q9HB21 404 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 A6NIN4 97 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 KRT8P05787 483 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 MPZP25189 248 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 FASP25445 335 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 Q6ZSR3 168 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 SSX6Q7RTT6 188 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 YIPF7Q8N8F6 280 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 TBX5Q99593 518 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 HES4Q9HCC6 221 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 USE1Q9NZ43 259 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 OR14J1Q9UGF5 321 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 SLC22A13Q9Y226 551 aa20.09■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa20.08■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1W2PPE2 198 aa20.08■□□□□ 0.81
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1W2PR64 198 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms