RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-208	ENST00000490302	PF4V1	P10720	104 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	MAGEA2	P43356	314 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	BLCAP	P62952	87 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	SSX2	Q16385	188 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302		Q6ZS46	218 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	KRT77	Q7Z794	578 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	MED4	Q9NPJ6	270 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A0U1RQV5	110 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302		H3BN98	237 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	GSC2	O15499	205 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	TK1	P04183	234 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ATP6V1B1	P15313	513 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	CD83	Q01151	205 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	REEP1	Q9H902	201 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	SYNGR1	O43759	233 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	NXPH2	O95156	264 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	DYNLT3	P51808	116 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	DLX6	P56179	175 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302		J3QT63	122 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	F2RL2	O00254	374 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PF4	P02776	101 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ATP6V1B2	P21281	511 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	HAAO	P46952	286 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR12D2	P58182	307 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC35A2	P78381	396 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PRODH	O43272	600 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	NRAS	P01111	189 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PKDCC-208	ENST00000490302		H3BUI4	141 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	PSMD9	O00233	223 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	IGLV3-1	P01715	115 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	RBP4	P02753	201 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	HCCS	P53701	268 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC34A1	Q06495	639 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	TEAD3	Q99594	435 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PKDCC-208	ENST00000490302	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.96	□□□□□ -0.18

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