RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486810.5

COPS3-209, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 938 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-209ENST00000486810 ASCL1P50553 236 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HIST1H2BDP58876 126 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 PLP1P60201 277 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HIST1H2BCP62807 126 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 BTN3A2P78410 334 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 FZD2Q14332 565 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 TAF13Q15543 124 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 TEX38Q6PEX7 206 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 C17orf99Q6UX52 265 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SIAH3Q8IW03 269 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 BMPERQ8N8U9 685 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 OR4D11Q8NGI4 311 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 OR56B4Q8NH76 319 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 OR8D1Q8WZ84 308 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 FAM3CQ92520 227 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 IGSF8Q969P0 613 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 PNPLA2Q96AD5 504 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 MOAP1Q96BY2 351 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 DIRAS2Q96HU8 199 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SLC35G5Q96KT7 338 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 VSTM2LQ96N03 204 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 MBOAT4Q96T53 435 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SYT11Q9BT88 431 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 C20orf24Q9BUV8 137 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ARL6Q9H0F7 186 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SLC32A1Q9H598 525 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 PIGVQ9NUD9 493 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 PILRBQ9UKJ0 227 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 MEMO1Q9Y316 297 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 YIPF1Q9Y548 306 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 TRIP11Q15643 1979 aa4.7□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 CACNA1SQ13698 1873 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 A0A0J9YY10 115 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 A0A1B0GX78 115 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 A0A1W2PR80 420 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 RNF222A6NCQ9 220 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 E5RGE8 158 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 F5H6K3 240 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 FOXH1O75593 365 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 IFNA1P01562 189 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HBZP02008 142 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 IL5P05113 134 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ISG15P05161 165 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ICAM1P05362 532 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 PGAM2P15259 253 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 AGTR1P30556 359 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 CCKBRP32239 447 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 INPP1P49441 399 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 GNG3P63215 75 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ST3GAL3Q11203 375 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 MEF2DQ14814 521 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 ZNF766Q5HY98 468 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 BCL2L15Q5TBC7 163 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 BCORP1Q8N888 145 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 CDRT4Q8N9R6 151 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
COPS3-209ENST00000486810 OR5AP2Q8NGF4 316 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms