RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483778.5

ATG4B-221, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 1,103 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-221ENST00000483778 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 POC1AQ8NBT0 407 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 MROQ9BYG7 248 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 OR5B21A6NL26 309 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 GYG2O15488 501 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 GSC2O15499 205 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF254O75437 659 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 CCL3L1P16619 93 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 PRDX2P32119 198 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 CAPZA1P52907 286 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 PIFOQ8TCI5 191 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-221ENST00000483778 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 BTBD17A6NE02 478 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 H3BSH0 61 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 PGA5P0DJD9 388 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ATP6V1B1P15313 513 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 HAAOP46952 286 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 BMXP51813 675 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 CXCR4P61073 352 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 TMEM42Q69YG0 159 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 SSX6Q7RTT6 188 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 UBE2FQ969M7 185 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 RASL12Q9NYN1 266 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 V9GYS6 101 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 F8VVB4 439 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 F8VWA3 439 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 DHRS3O75911 302 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 BLMHQ13867 455 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF273Q14593 569 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ASRGL1Q7L266 308 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 CALHM1Q8IU99 346 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 OR2T27Q8NH04 317 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 OR5R1Q8NH85 324 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 NRBF2Q96F24 287 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 J3QT63 122 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 CHST1O43916 411 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ESRRGP62508 458 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 C12orf73Q69YU5 71 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 TEX12Q9BXU0 123 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 R4GMQ9 66 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 ZAR1LA6NP61 321 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 NXPH2O95156 264 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 APOL3O95236 402 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-221ENST00000483778 COX7A1P24310 79 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms