RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 NPIPA2E9PIF3 369 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 NPIPA3F8WFD2 350 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PIGYQ3MUY2 71 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 IGSF11Q5DX21 431 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 Q7L0L9 218 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 NEK7Q8TDX7 302 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ST8SIA1Q92185 356 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PRRX2Q99811 253 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 F8VVB4 439 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 F8VWA3 439 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MFNGO00587 321 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PGA4P0DJD7 388 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PGA3P0DJD8 388 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ESPL1Q14674 2120 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 AKR7LQ8NHP1 331 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SMCO4Q9NRQ5 59 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 APOC1P02654 83 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CD27P26842 260 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PHYHD1Q5SRE7 291 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 LYPD6Q86Y78 171 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 POC1AQ8NBT0 407 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 UMAD1C9J7I0 102 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TAS2R46P59540 309 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SPEM2Q0P670 501 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC22A25Q6T423 547 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXW12Q6X9E4 464 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 DOK3Q7L591 496 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MISPQ8IVT2 679 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 C17orf78Q8N4C9 275 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PTX4Q96A99 478 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FAHD2AQ96GK7 314 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 LYZL4Q96KX0 146 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 C7orf77A4D0Y5 90 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PMS2P1A4D2B8 440 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TTLL8A6PVC2 850 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 HAGHQ16775 308 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 OR52M1Q8NGK5 317 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 POC1BQ8TC44 478 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF285Q96NJ3 590 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TWSG1Q9GZX9 223 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF442Q9H7R0 627 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 R4GN57 208 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP1P28562 367 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 RGS19P49795 217 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 GUK1Q16774 197 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 H3BP45 60 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 M0R135 149 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 HLA-GP17693 338 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 RPS10P46783 165 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PLPPR5Q32ZL2 321 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 IL34Q6ZMJ4 242 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF799Q96GE5 643 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PIGQQ9BRB3 760 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 OR51B6Q9H340 312 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF727A8MUV8 499 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SCGNO76038 276 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FBP1P09467 338 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 RAB30Q15771 203 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 RARRES2Q99969 163 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 COA4Q9NYJ1 87 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PIAS2O75928 621 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CST7O76096 145 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PIGCQ92535 297 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms