RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 ACSM4P0C7M7 580 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 NXPH1P58417 271 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 PAFAH1B2P68402 229 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF117Q03924 483 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 KCNMB1Q16558 191 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 NKG7Q16617 165 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 Q3ZCU0 254 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-202ENST00000356435 KIAA0040Q15053 153 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-202ENST00000356435 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-202ENST00000356435 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 SPACA5Q96QH8 159 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 PDFQ9HBH1 243 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 C21orf58P58505 322 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 RPL30P62888 115 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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