RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SLC2A8Q9NY64 477 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 FAM157AC9JC47 383 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A1P53007 311 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 SLC37A1P57057 533 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 MRGPRDQ8TDS7 321 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 NHSQ6T4R5 1651 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 PTGFRP43088 359 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 CDK5Q00535 292 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 FOXB2Q5VYV0 432 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 IL20Q9NYY1 176 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 RD3LP0DJH9 198 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 UBTD1Q9HAC8 227 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 FAM60AQ9NP50 221 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 LHX9Q9NQ69 397 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 DOK5Q9P104 306 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 GPR87Q9BY21 358 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 PLPP3O14495 311 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 PTTG1IPP53801 180 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM88Q6PEY1 159 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 C4orf45Q96LM5 186 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM147Q9BVK8 224 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 OCEL1Q9H607 264 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 NPTNQ9Y639 398 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 M0R296 226 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 FPR2P25090 351 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 KRTDAPP60985 99 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 FAM3AP98173 230 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 WDR31Q8NA23 367 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 AGFG2O95081 481 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 C19orf43Q9BQ61 176 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 WNT1P04628 370 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 CALCRP30988 508 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 Q1RN00 199 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1958Q8N8K9 716 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM77I1YAP6 450 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 DRD3P35462 400 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 MASP2O00187 686 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 C12orf10Q9HB07 376 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 SCN7AQ01118 1682 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF586Q9NXT0 402 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP11Q9UKA4 1901 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF205O95201 554 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 TNFSF14O43557 240 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 SPINK4O60575 86 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 OR2M7Q8NG81 312 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM211Q6ICI0 200 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 CBLN3Q6UW01 205 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 FBP1P09467 338 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 HRASP01112 189 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK15Q9H427 330 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 SCO1O75880 301 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 AKIP1Q9NQ31 210 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 GLI3P10071 1580 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEA5P43359 124 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf87Q6NUJ2 197 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 OR4F17Q8NGA8 305 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 F5H697 171 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM65Q6PI78 240 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 OR1L4Q8NGR5 311 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 CACFD1Q9UGQ2 172 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 PRR35P0CG20 571 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 BMI1P35226 326 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 GAMTQ14353 236 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 OR2W3Q7Z3T1 314 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF547Q8IVP9 402 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB44Q8NCP5 570 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 CCL4P13236 92 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 RHOBP62745 196 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 MOGAT1Q96PD6 335 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 ETFDHQ16134 617 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 TIGD3Q6B0B8 471 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 LIMS2Q7Z4I7 341 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 SRD5A2P31213 254 aa19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms