RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327443.8

SP1-201, Transcript of Sp1 transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SP1, Length 2,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1-201ENST00000327443 ZIC1Q15915 447 aa8.66□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 Q6ZS52 159 aa8.66□□□□□ -1.02
SP1-201ENST00000327443 Q6ZSR6 202 aa8.66□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 GRHL3Q8TE85 626 aa8.66□□□□□ -1.02
SP1-201ENST00000327443 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.66□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SP1-201ENST00000327443 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.66□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.66□□□□□ -1.02
SP1-201ENST00000327443 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.66□□□□□ -1.02
SP1-201ENST00000327443 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SP1-201ENST00000327443 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.66□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.65□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 HIST1H3AP68431 136 aa8.65□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.65□□□□□ -1.02
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SP1-201ENST00000327443 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
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SP1-201ENST00000327443 ZNF709Q8N972 641 aa8.65□□□□□ -1.03
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SP1-201ENST00000327443 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.65□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
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SP1-201ENST00000327443 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.65□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.65□□□□□ -1.03
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SP1-201ENST00000327443 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 ODAMA1E959 279 aa8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 TLCD2A6NGC4 264 aa8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 IFITM5A6NNB3 132 aa8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 PPIAL4DF5H284 164 aa8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 RAB29O14966 203 aa8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 RAMP3O60896 148 aa8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 BRI3O95415 125 aa8.64□□□□□ -1.03
SP1-201ENST00000327443 CSN2P05814 226 aa8.64□□□□□ -1.03
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