RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 DGCR2P98153 550 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 VWA1Q6PCB0 445 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 OR4S2Q8NH73 311 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 FZR1Q9UM11 496 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 KLKB1P03952 638 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ACP1P24666 158 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 GCAP28676 217 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 OR3A4PP47883 348 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 KCNJ3P48549 501 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 OR4C3Q8NH37 302 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SMIM12Q96EX1 92 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 DOK1Q99704 481 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ADGRL4Q9HBW9 690 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 EPXP11678 715 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 GNG10P50151 68 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 NHLH1Q02575 133 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 NHLH2Q02577 135 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ATP6V1FQ16864 119 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 TEX29Q8N6K0 151 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.38□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SSPNQ14714 243 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ACY3Q96HD9 319 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 DHRS3O75911 302 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 CD200P41217 278 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 UBALD1Q8TB05 177 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 F2RL2O00254 374 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 HIST1H3AP68431 136 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 DIRC2Q96SL1 478 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 RNF2Q99496 336 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 PRRT4C9JH25 899 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SLC2A10O95528 541 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 PCMT1P22061 227 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ETFDHQ16134 617 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 KCNK15Q9H427 330 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 PRSS44E7EML9 344 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SPCS3P61009 180 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SHISA4Q96DD7 197 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SERTM1A2A2V5 107 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 UPK1AO00322 258 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 PI3P19957 117 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 NPY1RP25929 384 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 EMDP50402 254 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 CEACAM3P40198 252 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 KHDC3LQ587J8 217 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SARGQ9BW04 601 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ALG1L2C9J202 215 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 ZNF737O75373 536 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SPRY3O43610 288 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 DEDDO75618 318 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 CD3EP07766 207 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 GALP22466 123 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 MMP15P51511 669 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 MLF1P58340 268 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 C4orf45Q96LM5 186 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 FPR2P25090 351 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.37□□□□□ -1.07
CUX1-201ENST00000292535 TMEM202A6NGA9 273 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms