RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 POU2F2P09086 479 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GPR89BP0CG08 455 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PNMTP11086 282 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TCN2P20062 427 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SNCAP37840 140 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GLO1Q04760 184 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CD226Q15762 336 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 VASH2Q86V25 355 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 C5orf34Q96MH7 638 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR2A5Q96R48 311 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CHST5Q9GZS9 411 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LAMA5O15230 3695 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 H0YL77 283 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR8G1Q15617 311 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OPN5Q6U736 354 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LRP11Q86VZ4 500 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SULF2Q8IWU5 870 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR5H15A6NDH6 313 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR5H1A6NKK0 313 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CER1O95813 267 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TAS2R60P59551 318 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SLC35A1P78382 337 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 FMODQ06828 376 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 FHL5Q5TD97 284 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HOGA1Q86XE5 327 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 BCORP1Q8N888 145 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CUTCQ9NTM9 273 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RAB1AP62820 205 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 AQP3Q92482 292 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TCTN2Q96GX1 697 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GPR132Q9UNW8 380 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF708P17019 499 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ALDH3B1P43353 468 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PKIAP61925 76 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 UNC119Q13432 240 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 UBE2V2Q15819 145 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PMM1Q92871 262 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM230Q96A57 120 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RAB39BQ96DA2 213 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TAAR9Q96RI9 348 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RFNGQ9Y644 331 aa9.57□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PRSS37A4D1T9 235 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF724A8MTY0 619 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 H3BQ15 152 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SOD3P08294 240 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PAX6P26367 422 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CRABP1P29762 137 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR52N5Q8NH56 324 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR5B2Q96R09 309 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms