RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PCNTO95613 3336 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PLXNB2O15031 1838 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PRRG2O14669 202 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 OR2F1Q13607 317 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 IRF3Q14653 427 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 HES3Q5TGS1 186 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 LYPD8Q6UX82 237 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ASB5Q8WWX0 329 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PP6455Q8WZ26 134 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 LHX4Q969G2 390 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 SARAFQ96BY9 339 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 NTMQ9P121 344 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 GPR160Q9UJ42 338 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 SH2D1BO14796 132 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 SEMA7AO75326 666 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PNPP00491 289 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 IGHA1P01876 353 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 FUT3P21217 361 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 MAGEA5P43359 124 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 RAC1P63000 192 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 IL11RAQ14626 422 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 NAA40Q86UY6 237 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ZNF573Q86YE8 665 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 OR2Z1Q8NG97 314 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 C2orf50Q96LR7 162 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ZNF391Q9UJN7 358 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 TCFL5Q9UL49 500 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 CEP350Q5VT06 3117 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 LIPT2A6NK58 231 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 OGG1O15527 345 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 AQP8O94778 261 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 CD37P11049 281 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 UBE2G2P60604 165 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 TLE4Q04727 773 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 RBPJQ06330 500 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 DMWDQ09019 674 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 D2HGDHQ8N465 521 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 OR2Y1Q8NGV0 311 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 OR6S1Q8NH40 331 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 VWCEQ96DN2 955 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 TAAR9Q96RI9 348 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 GPHA2Q96T91 129 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 SIPA1L1O43166 1804 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 WDR90Q96KV7 1748 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GTQ1 180 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 UMAD1C9J7I0 102 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 TO15178 435 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PTP4A3O75365 173 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 DHRS3O75911 302 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 JTBO76095 146 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ACKR3P25106 362 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 MEOX1P50221 254 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 SOX8P57073 446 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ZNF766Q5HY98 468 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 CT55Q8WUE5 264 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 AKR1E2Q96JD6 320 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PIGMQ9H3S5 423 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PROCRQ9UNN8 238 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 A0A0J9YW62 118 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PRD5 423 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PRF3 423 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms