RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 A0A087WZY1 265 aa22.26■■□□□ 1.15
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RAB40C-201ENST00000248139 ZNF84P51523 738 aa22.26■■□□□ 1.15
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RAB40C-201ENST00000248139 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 HIST2H3AQ71DI3 136 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 SLC16A14Q7RTX9 510 aa22.26■■□□□ 1.15
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RAB40C-201ENST00000248139 FAM122CQ6P4D5 195 aa22.24■■□□□ 1.15
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RAB40C-201ENST00000248139 CARD18P57730 90 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 B3GALT5-AS1P59052 145 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 Q0VFX4 171 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 CLRN3Q8NCR9 226 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 ARL11Q969Q4 196 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa22.22■■□□□ 1.15
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