RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637594.1

CLN8-214, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-214ENST00000637594 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ZNF702PQ9H963 129 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 BRD7Q9NPI1 651 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 NDE1Q9NXR1 346 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.13□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PLXNB1O43157 2135 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OR5B21A6NL26 309 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 FAM183AA6NL82 134 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 C17orf98A8MV24 154 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PRODHO43272 600 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ANGPTL7O43827 346 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 CHST1O43916 411 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 SNX3O60493 162 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 E2F6O75461 281 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PRDX2P32119 198 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 GMFBP60983 142 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 LY6EQ16553 131 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 C16orf89Q6UX73 402 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 CD177Q8N6Q3 437 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 POC1AQ8NBT0 407 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OR2T29Q8NH02 315 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 THEM6Q8WUY1 208 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OR4F4Q96R69 305 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 YY1AP1Q9H869 796 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 MED20Q9H944 212 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 MED4Q9NPJ6 270 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 USE1Q9NZ43 259 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 A6NDX4 124 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 FBXO24O75426 580 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 SOX14O95416 240 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 RBP4P02753 201 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 HMGN1P05114 100 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PGA5P0DJD9 388 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 CD28P10747 220 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 BMXP51813 675 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 DLX6P56179 175 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 LGALS4P56470 323 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ERVFRD-1P60508 538 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 CDK5Q00535 292 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ROM1Q03395 351 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 TMEM42Q69YG0 159 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 Q6ZSR3 168 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 MRAPQ8TCY5 172 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 FEVQ99581 238 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 MMP28Q9H239 520 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 MUC13Q9H3R2 512 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 REEP1Q9H902 201 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 HES4Q9HCC6 221 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 FAM206AQ9NX38 181 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 VNN3Q9NY84 501 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 TCF19Q9Y242 345 aa7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.1□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.1□□□□□ -1.27
CLN8-214ENST00000637594 ODF3BA8MYP8 253 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms