RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591833.5

SEPT9-240, Transcript of septin 9, human

TSL 4

Gene SEPT9, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEPT9-240	ENST00000591833	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	IER3	P46695	156 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	CDK5	Q00535	292 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	GINS1	Q14691	196 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	STUM	Q69YW2	141 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53	3e-6	■□□□□ 10.5
SEPT9-240	ENST00000591833	MED30	Q96HR3	178 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833		Q96MT0	163 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	CRHBP	P24387	322 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	POU1F1	P28069	291 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	RELB	Q01201	579 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	PRDX4	Q13162	271 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	APOF	Q13790	326 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	CITED1	Q99966	193 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833		A0A0U1RQK1	487 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833		A0A0U1RQV5	110 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC1A7	O00341	560 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	TIMM23	O14925	209 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	GPR137B	O60478	399 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	SELENOF	O60613	162 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	FBP1	P09467	338 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	AMY2B	P19961	511 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ALOX5AP	P20292	161 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ACKR3	P25106	362 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	EPHA2	P29317	976 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DCTD	P32321	178 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	MAP2K3	P46734	347 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	CPO	Q8IVL8	374 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	PIGC	Q92535	297 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	RNF170	Q96K19	258 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	CLN6	Q9NWW5	311 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833		A0A1B0GW55	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	KCNAB3	O43448	404 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	CAV3	P56539	151 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	GNG3	P63215	75 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	IKZF1	Q13422	519 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF773	Q6PK81	442 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SEPT9-240	ENST00000591833	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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