RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 TMEM156Q8N614 296 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 CD5LO43866 347 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 TSC22D2O75157 780 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 DHRS3O75911 302 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR2J2O76002 312 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 PNPP00491 289 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 IL2RAP01589 272 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 TTRP02766 147 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 HPXP02790 462 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 CD3DP04234 171 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 AMY2AP04746 511 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 NAT1P18440 290 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 PRKACBP22694 351 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 CPT2P23786 658 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 CD34P28906 385 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 SRD5A2P31213 254 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 PMELP40967 661 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 RAD52P43351 418 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 ZP1P60852 638 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 H3F3AP84243 136 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 PMP22Q01453 160 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MADCAM1Q13477 382 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MELKQ14680 651 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 FBLN7Q53RD9 439 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 Q5BKY6 102 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 DRAM2Q6UX65 266 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 LYPD8Q6UX82 237 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 LYG2Q86SG7 212 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 NAA40Q86UY6 237 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 BEST3Q8N1M1 668 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 COQ8AQ8NI60 647 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 MITD1Q8WV92 249 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 IP6K3Q96PC2 410 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR5B2Q96R09 309 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 AMELYQ99218 206 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 OR10A2Q9H208 303 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 CENPMQ9NSP4 180 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 DKKL1Q9UK85 242 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 VDAC3Q9Y277 283 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 CR1P17927 2039 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-218ENST00000584243 TENM2Q9NT68 2774 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GTI1 187 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 LEUTXA8MZ59 168 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 H3BML4 177 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TEX46H3BTG2 121 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 RAB27BO00194 218 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 KDM4BO94953 1096 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 VENTXO95231 258 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FOXL2P58012 376 aa7.02□□□□□ -1.29
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