RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ABCB9Q9NP78 766 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 USE1Q9NZ43 259 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 COPS3Q9UNS2 423 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 WIPF1O43516 503 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CST4P01036 141 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 KRT8P05787 483 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GSTT2P0CG29 244 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GSTT2BP0CG30 244 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 EGR1P18146 543 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CRHBPP24387 322 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ACKR3P25106 362 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DCTDP32321 178 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PSMB10P40306 273 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH3A2P51648 485 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 HILS1P60008 231 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CDC42P60953 191 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ROM1Q03395 351 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 IL18R1Q13478 541 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CEP78Q5JTW2 689 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 WDR82Q6UXN9 313 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 USP43Q70EL4 1123 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 WDR86Q86TI4 376 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SPARTQ8N0X7 666 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CADM3Q8N126 398 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CCL13Q99616 98 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 APOL4Q9BPW4 351 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GPR84Q9NQS5 396 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CLN6Q9NWW5 311 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FAM206AQ9NX38 181 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF69Q9UC07 566 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0U1RQV5 110 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM210A6NLX4 147 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF732B4DXR9 585 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 J3QRK9 145 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DVL1O14640 695 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 EI24O14681 340 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 AKR7A2O43488 359 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFB3O43676 98 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 APOL3O95236 402 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LHBP01229 141 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LIPFP07098 398 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T7P0C7T2 308 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 HTR1FP30939 366 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MTNR1AP48039 350 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GPM6AP51674 278 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FGF12P61328 243 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 EFNB1P98172 346 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 EGR3Q06889 387 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms