RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559561.5

MEIS2-215, Transcript of Meis homeobox 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene MEIS2, Length 1,442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEIS2-215	ENST00000559561	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CCDC120	Q96HB5	630 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	BANF2	Q9H503	90 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ZZEF1	O43149	2961 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ITPR1	Q14643	2758 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CENPX	A8MT69	81 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	LPL	P06858	475 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SERPINA2	P20848	420 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	BTC	P35070	178 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	KIR2DL3	P43628	341 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ERVS71-1	P61550	626 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	NAAA	Q02083	359 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	FAM27E3	Q08E93	113 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CMBL	Q96DG6	245 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	KLK11	Q9UBX7	282 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	FUOM	A2VDF0	154 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ANGPTL7	O43827	346 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	LILRA1	O75019	489 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	RBBP9	O75884	186 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	MELTF	P08582	738 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CPT2	P23786	658 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SLC6A1	P30531	599 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CALCR	P30988	508 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF83	P51522	516 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	BCAP31	P51572	246 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ACTB	P60709	375 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ACTG1	P63261	375 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	LY6D	Q14210	128 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	RSU1	Q15404	277 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561		Q6ZTK2	550 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CALHM1	Q8IU99	346 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SEH1L	Q96EE3	360 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561		Q96M66	194 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	C16orf97	H3BN30	126 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561		M0R1B8	84 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	PLAT	P00750	562 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	IGKV1D-12	P01611	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CSF1	P09603	554 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	GPM6A	P51674	278 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	PSG7	Q13046	419 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SSX8	Q7RTT4	187 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF611	Q8N823	705 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	RNF170	Q96K19	258 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	SPTA1	P02549	2419 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.65	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms