RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 WDR82Q6UXN9 313 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 Q6ZS46 218 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 WDR86Q86TI4 376 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ADCK1Q86TW2 530 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 Q8N2B8 174 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 MUC7Q8TAX7 377 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 GIPC3Q8TF64 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 MYDGFQ969H8 173 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 AJUBAQ96IF1 538 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 FN3KQ9H479 309 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 LYSTQ99698 3801 aa6.5□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 MEGF11A6BM72 1044 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ERICH4A6NGS2 130 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 F2RL2O00254 374 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 DCTN6O00399 190 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 AKR7A2O43488 359 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 RENP00797 406 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ARG1P05089 322 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 AMY2BP19961 511 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 TGM4P49221 684 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 RPS6KA3P51812 740 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 PRKXP51817 358 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 BLCAPP62952 87 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 CD83Q01151 205 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 TSPAN31Q12999 210 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ATP6AP1Q15904 470 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 TIGD6Q17RP2 521 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 SLC36A3Q495N2 470 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 Q8NFD4 153 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 PIFOQ8TCI5 191 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 STMN2Q93045 179 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 NRBF2Q96F24 287 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 MED30Q96HR3 178 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 FEVQ99581 238 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 COPS4Q9BT78 406 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 VNN3Q9NY84 501 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.49□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 LCE6AA0A183 80 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 A6NDX4 124 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 G3V2T6 193 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 SIGLEC5O15389 551 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 LYL1P12980 280 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ANXA8P13928 327 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF823P16415 610 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 PRKACGP22612 351 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 NOS3P29474 1203 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 GSSP48637 474 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 RAB25P57735 213 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ERVFRD-1P60508 538 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 DGCR2P98153 550 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 SSX2Q16385 188 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.48□□□□□ -1.37
PCNX1-215ENST00000557428 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms