RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556082.5

ATXN3-235, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-235ENST00000556082 Q8NFD4 153 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PXT1Q8NFP0 134 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 RAB3CQ96E17 227 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 RNF170Q96K19 258 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.17□□□□□ -1.26
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ATXN3-235ENST00000556082 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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ATXN3-235ENST00000556082 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 Q6ZT83 130 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 FTMTQ8N4E7 242 aa7.15□□□□□ -1.26
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