RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A0B4J2E0	115 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1B0GX12	115 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1W2PNR3	127 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF195	O14628	629 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NKX2-8	O15522	239 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EPCAM	P16422	314 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF43	P17038	809 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PDX1	P52945	283 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	P2RY6	Q15077	328 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	UPRT	Q96BW1	309 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZIC5	Q96T25	663 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ARHGEF11	O15085	1522 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NAIP	Q13075	1403 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CIT	O14578	2027 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ADM5	C9JUS6	153 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	APOA2	P02652	100 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SP1	P08047	785 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR1D4	P47884	311 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	INPP1	P49441	399 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	THBS3	P49746	956 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GNG4	P50150	75 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RUNX1	Q01196	453 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MFAP5	Q13361	173 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OTP	Q5XKR4	325 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	BMPER	Q8N8U9	685 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CDH20	Q9HBT6	801 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MED14	O60244	1454 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	C17orf100	A8MU93	164 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EFNA2	O43921	213 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PVR	P15151	417 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	P2RY1	P47900	373 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF134	P52741	427 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		Q6ZSR3	168 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PKMYT1	Q99640	499 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1W2PRS3	328 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	IDS	B3KWA1	339 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR4Q2	P0C623	313 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CD33	P20138	364 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	AADAC	P22760	399 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OPRD1	P41143	372 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CLDN6	P56747	220 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LY6K	Q17RY6	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		Q6ZT83	130 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NUS1	Q96E22	293 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		R4GN57	208 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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