RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 A6NDX4 124 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 RFPL4AA6NLU0 287 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 NDUFAB1O14561 156 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 CST4P01036 141 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 ARG1P05089 322 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 PF4V1P10720 104 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 OPRL1P41146 370 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 SLC25A1P53007 311 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 RPL31P62899 125 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 SSX2Q16385 188 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 FAM76BQ5HYJ3 339 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 LIAT1Q6ZQX7 453 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 THAP5Q7Z6K1 395 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 FTMTQ8N4E7 242 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 THEM6Q8WUY1 208 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 PRSS22Q9GZN4 317 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 OR51I2Q9H344 312 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 ABCB10Q9NRK6 738 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 IL20Q9NYY1 176 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 CD300AQ9UGN4 299 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 TNFRSF11BO00300 401 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 SASH3O75995 380 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 GLCEO94923 617 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 GSTT1P30711 240 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 MOB3CQ70IA8 216 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 Q8N2B8 174 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 IQCF1Q8N6M8 205 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 OR5AU1Q8NGC0 362 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 OR8B12Q8NGG6 310 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 OR5K1Q8NHB7 308 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 SDSLQ96GA7 329 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 C1orf21Q9H246 121 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 OR51V1Q9H2C8 321 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 MUC13Q9H3R2 512 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 GORASP2Q9H8Y8 452 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 SPAG4Q9NPE6 437 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 SYNGR1O43759 233 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 SELENOFO60613 162 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 APOC1P02654 83 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 ACP7Q6ZNF0 438 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 AQP11Q8NBQ7 271 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 AQP3Q92482 292 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 NSMCE2Q96MF7 247 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 USE1Q9NZ43 259 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 OR14J1Q9UGF5 321 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 HILPDAQ9Y5L2 63 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-227ENST00000551441 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 ARPC2O15144 300 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 CCDC22O60826 627 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 CCNB2O95067 398 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 PF4P02776 101 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 PRDX2P32119 198 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 GNG3P63215 75 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 CD69Q07108 199 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 SNCBQ16143 134 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 OR2T33Q8NG76 320 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 ZNF671Q8TAW3 534 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 RPS4Y2Q8TD47 263 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 RGCCQ9H4X1 137 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 IL1RAPQ9NPH3 570 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 VGLL3A8MV65 326 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 PSMD9O00233 223 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 IFNGP01579 166 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 LYNP07948 512 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 FAHP16930 419 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 HCCSP53701 268 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 CD83Q01151 205 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 PLCXD3Q63HM9 321 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 C10orf99Q6UWK7 81 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 SHFQ7M4L6 423 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 COMMD2Q86X83 199 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 DTX3Q8N9I9 347 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 OCSTAMPQ9BR26 566 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 ABCB9Q9NP78 766 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 VNN3Q9NY84 501 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 U3KQV3 271 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PPH5 198 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms