RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 ITPKCQ96DU7 683 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 A0A0A6YYJ9 748 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PRRG2O14669 202 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 DHFRP00374 187 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SFTPBP07988 381 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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CS-215ENST00000549143 ACTBP60709 375 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ACTG1P63261 375 aa7.26□□□□□ -1.25
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CS-215ENST00000549143 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF611Q8N823 705 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PTX4Q96A99 478 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 WBP1Q96G27 269 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 IFT46Q9NQC8 304 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 COL12A1Q99715 3063 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 RAB3DO95716 219 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 IGKV1D-12P01611 117 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CSF1P09603 554 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 COX5BP10606 129 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 NPBWR2P48146 333 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ATP1B3P54709 279 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PIGYQ3MUY2 71 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FTMTQ8N4E7 242 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.25□□□□□ -1.25
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CS-215ENST00000549143 METTL9Q9H1A3 318 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ARID1AO14497 2285 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PLCE1Q9P212 2302 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF732B4DXR9 585 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 AMY2AP04746 511 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 NAT2P11245 290 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SELEP16581 610 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 DUSP1P28562 367 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FABP6P51161 128 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FUT6P51993 359 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FAM27E3Q08E93 113 aa7.25□□□□□ -1.25
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CS-215ENST00000549143 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.25□□□□□ -1.25
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CS-215ENST00000549143 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.25□□□□□ -1.25
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CS-215ENST00000549143 ZNF75AQ96N20 296 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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CS-215ENST00000549143 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FAM221AA4D161 298 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 HSPB6O14558 160 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CHRM2P08172 466 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 UBBP0CG47 229 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 AKAIN1P0CW23 69 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 HRH1P35367 487 aa7.24□□□□□ -1.25
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