RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.23□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51F2Q8NH61 342 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A28Q96A46 364 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEP19Q96LK0 163 aa7.23□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.23□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTDSP2O14595 271 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM127O75204 238 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLPXO76031 633 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KDM4BO94953 1096 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HTR3BO95264 441 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BPNT1O95861 308 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BATF2Q8N1L9 274 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GHRLQ9UBU3 117 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNGR1O43759 233 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHBDL1O75783 438 aa7.21□□□□□ -1.26
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOD3P08294 240 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IRF2P14316 349 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFRSF1AP19438 455 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERPINA2P20848 420 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ART1P52961 327 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZP1P60852 638 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GMFBP60983 142 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL24Q13007 206 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF154Q13106 437 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR176Q14439 515 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MPPED2Q15777 294 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRNQ5BIV9 151 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASCL4Q6XD76 172 aa7.21□□□□□ -1.26
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