RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		Q8N402	240 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	IFT81	Q8WYA0	676 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	LZIC	Q8WZA0	190 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	NABP1	Q96AH0	204 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PKMYT1	Q99640	499 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SIAE	Q9HAT2	523 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GIN1	Q9NXP7	522 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	THYN1	Q9P016	225 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ING4	Q9UNL4	249 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CPQ	Q9Y646	472 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	F8	P00451	2351 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	MYLK	Q15746	1914 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SCN1A	P35498	2009 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1B0GWB2	263 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	C15orf61	A6NNL5	157 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	EFCAB7	A8K855	629 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	C16orf97	H3BN30	126 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		K7EQG2	157 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SLC31A1	O15431	190 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CTDNEP1	O95476	244 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	APOD	P05090	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	FABP1	P07148	127 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR4E1	P0C645	316 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CT45A6	P0DMU7	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ATP6V1B2	P21281	511 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZP3	P21754	424 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	LMO2	P25791	158 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GCK	P35557	465 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OPRL1	P41146	370 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	BID	P55957	195 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	UNC119	Q13432	240 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PDK2	Q15119	407 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TMED2	Q15363	201 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TGIF1	Q15583	401 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	MUC21	Q5SSG8	566 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CPTP	Q5TA50	214 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	DRAM2	Q6UX65	266 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	NFE4	Q86UQ8	179 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	HOGA1	Q86XE5	327 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	WDR31	Q8NA23	367 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	YIPF6	Q96EC8	236 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ATF6B	Q99941	703 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TFR2	Q9UP52	801 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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