RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARL9Q6T311 187 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 DRAM2Q6UX65 266 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF144BQ7Z419 303 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF101Q8IZC7 436 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR52N1Q8NH53 320 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A40Q8TBP6 338 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 GHSRQ92847 366 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEUROG1Q92886 237 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM203Q969S6 136 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MBD6Q96DN6 1003 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 PIK3IP1Q96FE7 263 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM68Q96MH6 324 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MND1Q9BWT6 205 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MMP27Q9H306 513 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 SP140LQ9H930 580 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM206AQ9NX38 181 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 FZR1Q9UM11 496 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 DHDHQ9UQ10 334 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 RELNP78509 3460 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1B0GTI1 187 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1W2PPK0 400 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 A6NIN4 97 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 SHISA9B4DS77 424 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 E7EQL1 145 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 H3BSA7 217 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYT7O43581 403 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLPP2O43688 288 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPRIN2O60269 458 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZFPL1O95159 310 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTRP02766 147 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR4A8P0C604 315 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMIM18P0DKX4 95 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MMP9P14780 707 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 COX6B1P14854 86 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 PSMB9P28065 219 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 GLRXP35754 106 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MPV17P39210 176 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPL5P46777 297 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 TGM4P49221 684 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 RGS6P49758 472 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 GP2P55259 537 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP1CBP62140 327 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACTA2P62736 377 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACTG2P63267 376 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPOCK1Q08629 439 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACSM1Q08AH1 577 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPR50Q13585 617 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR38Q5JTN6 314 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 GLYATL3Q5SZD4 288 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 BCL2L15Q5TBC7 163 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM244Q5VVB8 128 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2T2Q6IF00 324 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF544Q6NX49 715 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MOB3CQ70IA8 216 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRP11Q86VZ4 500 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACBD4Q8NC06 268 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR8B12Q8NGG6 310 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR52H1Q8NGJ2 320 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR5AK2Q8NH90 309 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2AE1Q8NHA4 323 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 FGGYQ96C11 551 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 HAVCR1Q96D42 359 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 R3HDM4Q96D70 268 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 REEP6Q96HR9 211 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 LYZL4Q96KX0 146 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OPALINQ96PE5 141 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 DOK1Q99704 481 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 BCL2L14Q9BZR8 327 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-205ENST00000519068 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms