RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TSPAN9	O75954	239 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		H0YAE9	185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	GSC2	O15499	205 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF254	O75437	659 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	PSG2	P11465	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	HCCS	P53701	268 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ROM1	Q03395	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	FLOT2	Q14254	428 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	PNKD	Q8N490	385 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	AQP3	Q92482	292 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	PSMD9	O00233	223 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PRKACG	P22612	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CAPZA1	P52907	286 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CBX1	P83916	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	SDSL	Q96GA7	329 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	TEAD3	Q99594	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1W2PPH5	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	FKBP6	O75344	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	TSPAN15	O95858	294 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	IGLV3-1	P01715	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	FAH	P16930	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	EGR3	Q06889	387 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MOB3C	Q70IA8	216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601		H3BUX3	64 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC1A7	O00341	560 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	DHRS3	O75911	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	NRAS	P01111	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	GABRA5	P31644	462 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CRISP1	P54107	249 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF561	Q8N587	486 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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