RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 R4GMQ9 66 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SLC17A2O00624 439 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TWIST1Q15672 202 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PEX11GQ96HA9 241 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CITED1Q99966 193 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CHST11Q9NPF2 352 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 NMUP48645 174 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 BEND2Q8NDZ0 799 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.3□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 GPR3P46089 330 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PKDCCQ504Y2 493 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CXorf1O96002 111 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ACVR1Q04771 509 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM64Q6YI46 380 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 Q8IYB0 196 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TIMP4Q99727 224 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 GPR75O95800 540 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 NEUROG1Q92886 237 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SERINC4A6NH21 518 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SEC11BP0C7V7 166 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OR1D5P58170 312 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 XAF1Q6GPH4 301 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MGST2Q99735 147 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 RER1O15258 196 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 IAPPP10997 89 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MDGA1Q8NFP4 955 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 WNT10BO00744 389 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 HBZP02008 142 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 RELBQ01201 579 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 JKAMPQ9P055 326 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SFT2D2O95562 160 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CLDN10P78369 228 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 F5P12259 2224 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PDPNQ86YL7 162 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ISOC2Q96AB3 205 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SEMG2Q02383 582 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PYCR3Q53H96 274 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.29□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OR2V2Q96R30 315 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PP6455Q8WZ26 134 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PDXPQ96GD0 296 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SHDQ96IW2 340 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PRR14Q9BWN1 585 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PCNX2A6NKB5 2137 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 FITM1A5D6W6 292 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SLCO2B1O94956 709 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 LBX2Q6XYB7 198 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 Q6ZVL8 140 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 FIGLAQ6QHK4 219 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1W2PPC4 97 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CFHP08603 1231 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 RIMKLAQ8IXN7 391 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 C5AR2Q9P296 337 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 FCMRO60667 390 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 BCL2P10415 239 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 EVX2Q03828 476 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OR8B8Q15620 311 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF250P15622 560 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM33P57088 247 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 HTR3DQ70Z44 454 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 LRRC18Q8N456 261 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 BOD1Q96IK1 185 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms