RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 ZNF273Q14593 569 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MICAQ29983 383 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MOB3CQ70IA8 216 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PRX2 142 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 A6NIN4 97 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TMEM210A6NLX4 147 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 H3BN98 237 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 SNX3O60493 162 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 LYNP07948 512 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 FAHP16930 419 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MAGEA2P43356 314 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 GYS2P54840 703 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MS4A2Q01362 244 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 BLMHQ13867 455 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 COMMD2Q86X83 199 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OR2T29Q8NH02 315 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OTOSQ8NHW6 89 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TEX47Q8TBZ9 253 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 AQP3Q92482 292 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 SGCDQ92629 289 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 R3HDM4Q96D70 268 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 FEVQ99581 238 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 LRP12Q9Y561 859 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 FBXO24O75426 580 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 APOC1P02654 83 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 GINS1Q14691 196 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 SHFQ7M4L6 423 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 CPOQ8IVL8 374 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 PHF21AQ96BD5 680 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 SDSLQ96GA7 329 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TEAD3Q99594 435 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 RGCCQ9H4X1 137 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 REEP1Q9H902 201 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 H3BSH0 61 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 INMTO95050 263 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 IGLL1P15814 213 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 PRKACGP22612 351 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 PRDX2P32119 198 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 BLVRAP53004 296 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 GNG3P63215 75 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 KRT77Q7Z794 578 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 FTMTQ8N4E7 242 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 OR2T27Q8NH04 317 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 NIPAL2Q9H841 368 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 GPR84Q9NQS5 396 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 GPR173Q9NS66 373 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 FAM206AQ9NX38 181 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-209ENST00000473257 COPS3Q9UNS2 423 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms