RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 BPIFCQ8NFQ6 507 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 RPEQ96AT9 228 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 SGTBQ96EQ0 304 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 UCK2Q9BZX2 261 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ZYG11BQ9C0D3 744 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 DYRK4Q9NR20 520 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 IL37Q9NZH6 218 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ITSN1Q15811 1721 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 KNDC1Q76NI1 1749 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 IFT172Q9UG01 1749 aa2.78□□□□□ -1.96
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SGCE-210ENST00000472326 TIAM2Q8IVF5 1701 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 TRIP11Q15643 1979 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 M0R1X1 148 aa2.76□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 CTRB1P17538 263 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 MYL9P24844 172 aa2.76□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 BTN1A1Q13410 526 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 SP6Q3SY56 376 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 Q6ZSR6 202 aa2.76□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 LAMB4A4D0S4 1761 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 CEP162Q5TB80 1403 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 LMO7Q8WWI1 1683 aa2.76□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 MUC3AQ02505 3323 aa2.75□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa2.75□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 KIF13BQ9NQT8 1826 aa2.75□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 CPDO75976 1380 aa2.74□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 LY75O60449 1722 aa2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 PKD1L2Q7Z442 2459 aa2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 USP54Q70EL1 1684 aa2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 SLC19A2O60779 497 aa2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 NELFEP18615 380 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 CARD17Q5XLA6 110 aa2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 FAM131AQ6UXB0 335 aa2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa2.74□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 R4GN34 69 aa2.74□□□□□ -1.97
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SGCE-210ENST00000472326 LAMA3Q16787 3333 aa2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 CENPFP49454 3210 aa2.74□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 ABCC6O95255 1503 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 E9PCH4 1651 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 C5P01031 1676 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 QRICH2Q9H0J4 1663 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 TSPAN11A1L157 253 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 C17orf51A8MQB3 221 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD65E5RJM6 399 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 J3QRE1 110 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 SLC16A7O60669 478 aa2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SGCE-210ENST00000472326 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
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