RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 USE1Q9NZ43 259 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 U3KQK5 164 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 PGAM5Q96HS1 289 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 RGCCQ9H4X1 137 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 C17orf98A8MV24 154 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF732B4DXR9 585 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 SEMG1P04279 462 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 SPI1P17947 270 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 OPRL1P41146 370 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 DYNLT3P51808 116 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 SMIM11AP58511 58 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CRMP1Q14194 572 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 SNCBQ16143 134 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 GLYATQ6IB77 296 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CGB2Q6NT52 195 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 RNF144BQ7Z419 303 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 FTMTQ8N4E7 242 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 AQP3Q92482 292 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ABCB9Q9NP78 766 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 A0A1W2PPE2 198 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 A0A1W2PPH5 198 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 A0A1W2PR64 198 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 A0A1W2PRV1 198 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 F2RL2O00254 374 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 APOC1P02654 83 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ALDOBP05062 364 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC159P0C7I6 412 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 PRDX2P32119 198 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CEP78Q5JTW2 689 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF626Q68DY1 528 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF488Q96MN9 340 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 IL20Q9NYY1 176 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 V9GYQ6 96 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CHRM2P08172 466 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 GNG3P63215 75 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 KRT74Q7RTS7 529 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CALHM1Q8IU99 346 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF561Q8N587 486 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CHID1Q9BWS9 393 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 RASL12Q9NYN1 266 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 C3orf84H3BNL1 204 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 COX4I1P13073 169 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 RRM2P31350 389 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 IFNGR2P38484 337 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 C1orf21Q9H246 121 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00888-201ENST00000468380 H2BFMP0C1H6 154 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 SLC34A1Q06495 639 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 LCN8Q6JVE9 175 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 PYURFQ96I23 114 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 OR8B4Q96RC9 309 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 MED20Q9H944 212 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 SLC1A7O00341 560 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 SLC22A2O15244 555 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 CLIC3O95833 236 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 TK1P04183 234 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 LPLP06858 475 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 CD24P25063 80 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 OR12D2P58182 307 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC00888-201ENST00000468380 POC1AQ8NBT0 407 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms