RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 GNG8Q9UK08 70 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ORC6Q9Y5N6 252 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ANK2Q01484 3957 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JMP0 313 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0X1KG70 313 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 DAPL1A0PJW8 107 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NJY4 79 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC30A6NM36 301 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 F8VVB4 439 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 F8VWA3 439 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 DVL1O14640 695 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SULT1C4O75897 302 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHA1P01876 353 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT8P05787 483 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SFTPBP07988 381 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 GNAO1P09471 354 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 LIMS3P0CW19 117 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 LIMS4P0CW20 117 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP9P14780 707 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1B1P15313 513 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 HNF1AP20823 631 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHA1P21709 976 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 TGM4P49221 684 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IL5RAQ01344 420 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 GALEQ14376 348 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ESCO2Q56NI9 601 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MEDAGQ5VYS4 303 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 STUMQ69YW2 141 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 XAF1Q6GPH4 301 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD2Q86X83 199 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CALHM1Q8IU99 346 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 NRG4Q8WWG1 115 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 AQP3Q92482 292 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 RFKQ969G6 155 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf36Q96KX1 117 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 GAFA1Q96PS6 74 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A7Q99884 636 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVK-18Q9QC07 812 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CLN8Q9UBY8 286 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM210A6NLX4 147 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA2P2A6NMY6 339 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF212BA8MTL3 300 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 J3QLI3 93 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 LALBAP00709 142 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNA2P01563 188 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 PSG2P11465 335 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1E1P36543 226 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ETV1P50549 477 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF12P61328 243 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 GNG3P63215 75 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 DGUOKQ16854 277 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 FDX2Q6P4F2 183 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 DOK3Q7L591 496 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CD177Q8N6Q3 437 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms