RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ITFG2Q969R8 447 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 RNFT2Q96EX2 444 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 WDFY2Q96P53 400 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ONECUT1Q9UBC0 465 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 NLKQ9UBE8 527 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 AASSQ9UDR5 926 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 V9GYS6 101 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1B0GTI1 187 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1B0GVI7 797 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 CATSPERDQ86XM0 798 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 RORBQ92753 470 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 TMIGD2Q96BF3 282 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 MBOAT4Q96T53 435 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 C9orf16Q9BUW7 83 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ADI1Q9BV57 179 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHA1Q9HB21 404 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 BAG2O95816 211 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 AMY2BP19961 511 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 KRT74Q7RTS7 529 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 PDZD9Q8IXQ8 264 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 AQP3Q92482 292 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 TBX15Q96SF7 602 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 CNTD2Q9H8S5 307 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ACOXLQ9NUZ1 547 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 OR2AT4A6NND4 320 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 SYT7O43581 403 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 SULT1C4O75897 302 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 HAAOP46952 286 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF85Q03923 595 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 BATF2Q8N1L9 274 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 NPRL2Q8WTW4 380 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 LHX4Q969G2 390 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ZDHHC16Q969W1 377 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF488Q96MN9 340 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 GAFA1Q96PS6 74 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 DAPL1A0PJW8 107 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 DLGAP1O14490 977 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 MMP9P14780 707 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 NDUFB7P17568 137 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 PRTN3P24158 256 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 TGM4P49221 684 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 IL13RA1P78552 427 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 C9orf139Q6ZV77 190 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ANGPTL6Q8NI99 470 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 MED30Q96HR3 178 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 SLC29A1Q99808 456 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 SIRPDQ9H106 197 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 SYNGR1O43759 233 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 DGUOKQ16854 277 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 DEFB112Q30KQ8 113 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 MEDAGQ5VYS4 303 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF788Q6ZQV5 615 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF573Q86YE8 665 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 DNTTIP1Q9H147 329 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 TNFRSF19Q9NS68 423 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-210ENST00000440825 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 PSG2P11465 335 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 ACTC1P68032 377 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 ACTA1P68133 377 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 OCLNQ16625 522 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 TUSC1Q2TAM9 212 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM42Q69YG0 159 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM185AQ8NFB2 350 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 GATAD2BQ8WXI9 593 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM89A2RUT3 159 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD61A6NGH8 418 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 SNTNA6NMZ2 147 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 J3QT63 122 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 GPR37O15354 613 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 SIGLEC5O15389 551 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 CCL1P22362 96 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 CAPZA1P52907 286 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 PDCD1Q15116 288 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 CDONQ4KMG0 1287 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 VMO1Q7Z5L0 202 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 RDH10Q8IZV5 341 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 STMN2Q93045 179 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 SLC25A28Q96A46 364 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 DCTN5Q9BTE1 182 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 SLC7A11Q9UPY5 501 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 FBN3Q75N90 2809 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 PQLC2LA1A4F0 135 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-210ENST00000440825 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms