RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 KRT74Q7RTS7 529 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 C8orf46Q8TAG6 207 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CHIAQ9BZP6 476 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 DUX4Q9UBX2 424 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 A0A0U1RQK1 487 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ZAR1LA6NP61 321 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FCN3O75636 299 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 NRASP01111 189 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FBP1P09467 338 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OMGP23515 440 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CAV3P56539 151 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 EGR3Q06889 387 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 NCR3LG1Q68D85 454 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF573Q86YE8 665 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GAFA1Q96PS6 74 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CLN6Q9NWW5 311 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 COPS3Q9UNS2 423 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 R4GMQ9 66 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1W2PPH5 198 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 M0R1W7 72 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CIB2O75838 187 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 NDUFA7O95182 113 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PAHP00439 452 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 KRT8P05787 483 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FAHP16930 419 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ATP6V1E1P36543 226 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CAPZA1P52907 286 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SMIM21Q3B7S5 101 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 C12orf73Q69YU5 71 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 KDM4DQ6B0I6 523 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FGFRL1Q8N441 504 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 AQP3Q92482 292 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OR52A1Q9UKL2 312 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 DLGAP1O14490 977 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 RHBDL1O75783 438 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 IGLV3-1P01715 115 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 AMY2BP19961 511 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 DGUOKQ16854 277 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 APOL4Q9BPW4 351 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 C1RLQ9NZP8 487 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 H0YAE9 185 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SLC1A7O00341 560 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 NPFFO15130 113 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 IGHV4-59P01825 116 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 TTRP02766 147 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PSG2P11465 335 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SELLP14151 372 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 IER3P46695 156 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 EFNB1P98172 346 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 YIPF7Q8N8F6 280 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OR5D13Q8NGL4 314 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 RFKQ969G6 155 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ADI1Q9BV57 179 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC78-204ENST00000439619 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1W2PPE2 198 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1W2PR64 198 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1W2PRV1 198 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 CLPSL1A2RUU4 121 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 PRR32B1ATL7 298 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 J3QT63 122 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 M0R129 80 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 GPR137BO60478 399 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 OR2T7P0C7T2 308 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 HAAOP46952 286 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 ACSM1Q08AH1 577 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 AMIGO2Q86SJ2 522 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC78-204ENST00000439619 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms