RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 NPBWR1P48145 328 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R46P59540 309 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 ECH1Q13011 328 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2V2Q15819 145 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00518Q8N0U6 118 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC18Q8N456 261 aa16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 PHYHD1Q5SRE7 291 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.34■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 MR1Q95460 341 aa16.34■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO24O75426 580 aa16.33■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 THBS4P35443 961 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL35P42766 123 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35A1P78382 337 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 GJC3Q8NFK1 279 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.33■□□□□ 0.21
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