RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGB1BP1O14713 200 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 STX7O15400 261 aaKnown RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDYNP01213 254 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINA7P05543 415 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM58BPP0C7Q3 252 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf89P0DMQ9 161 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-GP17693 338 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC2A5P22732 501 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLRA2P23416 452 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASP3P42574 277 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 LPAR6P43657 344 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 MXD1Q05195 221 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF345Q14585 488 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL15Q16663 113 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC36A3Q495N2 470 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCTD21Q4G0X4 260 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSP90B2PQ58FF3 399 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf152Q5JTZ5 239 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 HHATQ5VTY9 493 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM173BQ6P4H8 233 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM40Q6P9F5 258 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZSR6 202 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM17Q86X19 198 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZDHHC22Q8N966 263 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5J2Q8NH18 312 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 RARRES2Q99969 163 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 OMDQ99983 421 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 THTPAQ9BU02 230 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 AASSQ9UDR5 926 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKD1P98161 4303 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRBP23467 1997 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLPP1O14494 284 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL25O15444 150 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CREB3O43889 395 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 NME2P1O60361 137 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPZL2O60487 215 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PFKFB2O60825 505 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTP4A3O75365 173 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 RDH16O75452 317 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC175P0C221 793 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CECR9P0C854 216 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 UQCRBP14927 111 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNRHRP30968 328 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 QARSP47897 775 aaKnown RBP-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC18A1P54219 525 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLTPP55058 493 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCZ1BP86790 482 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFITM3Q01628 133 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFFO1Q0D2I5 559 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRDNQ13061 729 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 WFDC2Q14508 124 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAPRE2Q15555 327 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFSD14CQ5VZR4 134 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 LPCAT4Q643R3 524 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PATE2Q6UY27 113 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD23Q86SG2 305 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A9Q8IVM8 553 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 IQUBQ8NA54 791 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR56A4Q8NGH8 313 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM57AQ8TBR7 257 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PYROXD1Q8WU10 500 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC29Q8WV35 223 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 UCK1Q9HA47 277 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEF1Q9HAY2 307 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTRCQ9Y297 605 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN9AQ15858 1988 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAMTSL3P82987 1691 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL6A5A8TX70 2615 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 A6NCN8 305 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 F6UB75 175 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 K7EPK0 472 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRRG1O14668 218 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB5O15062 677 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCF21O43680 179 aa-2.28□□□□□ -2.77
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