RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF671Q8TAW3 534 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ABHD3Q8WU67 409 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SOSTQ9BQB4 213 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF416Q9BWM5 594 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 EXO5Q9H790 373 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 JKAMPQ9P055 326 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 RNF7Q9UBF6 113 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 KCNN3Q9UGI6 736 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 V9GY05 133 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC13O75165 2243 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GVI7 797 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PQ09 198 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FAM25AB3EWG3 89 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FAM25CB3EWG5 89 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FAM25GB3EWG6 89 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLC17A2O00624 439 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CTDSPLO15194 276 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TUSC2O75896 110 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TOXO94900 526 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 IGLV3-1P01715 115 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TTRP02766 147 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ACSM4P0C7M7 580 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CPN1P15169 458 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ELK1P19419 428 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CDAP32320 146 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SOX2P48431 317 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CX3CR1P49238 355 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 EVX1P49640 407 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PITPNAQ00169 270 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 IL18Q14116 193 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLC10A1Q14973 349 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TAF13Q15543 124 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PYDC2Q56P42 97 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CORO6Q6QEF8 472 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DPPA2Q7Z7J5 298 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 Q8N402 240 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 POC5Q8NA72 575 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OR6M1Q8NGM8 313 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OR13C3Q8NGS6 347 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ASB5Q8WWX0 329 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DPF1Q92782 380 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SPTSSAQ969W0 71 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 APH1AQ96BI3 265 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 C10orf35Q96D05 121 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 GFI1Q99684 422 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 GLRX2Q9NS18 164 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CENPMQ9NSP4 180 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 A0A0U1RQV5 110 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GTH9 108 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GVC2 190 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GVG6 124 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PPK0 400 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 OR6C6A6NF89 314 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 SLC22A20A6NK97 555 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms