RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409159.2

RAB1C-201, Transcript of RAB1C, member RAS oncogene family pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RAB1C, Length 606 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1C-201ENST00000409159 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 J3QT63 122 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 ABCD4O14678 606 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 CTAG2O75638 210 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 UPK1BO75841 260 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 KDM4BO94953 1096 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 CD3EP07766 207 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 TMEM225BP0DP42 221 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 MPV17P39210 176 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 OR3A4PP47883 348 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 UQCRFS1P47985 274 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 FABP6P51161 128 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 MMP15P51511 669 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 ERVS71-1P61550 626 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 BSPH1Q075Z2 132 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 IL24Q13007 206 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 OR8G1Q15617 311 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 ZNF79Q15937 498 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 C16orf87Q6PH81 154 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 Q8IYB0 196 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 OR8S1Q8NH09 359 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 FAM222BQ8WU58 562 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 FAM46BQ96A09 425 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 OR51B6Q9H340 312 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 OR51I2Q9H344 312 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 PLK3Q9H4B4 646 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 CA10Q9NS85 328 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB1C-201ENST00000409159 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 PLSCR5A0PG75 271 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ZNF732B4DXR9 585 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 SULT1C2O00338 296 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 CDC14BO60729 498 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 CA11O75493 328 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 HLA-DQB1P01920 261 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ADH4P08319 380 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 GTF2F2P13984 249 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 CA6P23280 308 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 CPT2P23786 658 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 CD200P41217 278 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 UNC119Q13432 240 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 IL18Q14116 193 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 PYDC2Q56P42 97 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 SLC22A25Q6T423 547 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 SETD6Q8TBK2 473 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ERGIC1Q969X5 290 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ING4Q9UNL4 249 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 WIPF3A6NGB9 483 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 GABARAPH6UMI1 98 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 J3QRK9 145 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ZG16O60844 167 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 MELTFP08582 738 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 CDK2P24941 298 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 CFHR2P36980 270 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 PMELP40967 661 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 PTH2RP49190 550 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 GPM6AP51674 278 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 TAS2R20P59543 309 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 RSU1Q15404 277 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 EFNB3Q15768 340 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 FAM209AQ5JX71 171 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 LINC00596Q86U02 117 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 Q8N402 240 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 ZNF611Q8N823 705 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 BHLHE23Q8NDY6 225 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 OR51F2Q8NH61 342 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB1C-201ENST00000409159 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms